[Pupkin]

Может быть несколько причин
1 - у вас в биосе стоит автоопределение диска, а диск невсегда корректно определяется (Ide-шлейф, Джамперы на ide-устройствах, проблема с электроникой винчестера)
2 - винчестер не успевает запуститься (мала мошьность БП, некорректные настройки биоса).
На многих современных матерях в биосе есть настройка задержки перед загрузкой системы. Если у вас есть такая настройка то поставьте её для начала на 2 сек. Если поможет - определите минимальное время задержки. Если не поможет, а подключено всё без ошибок - проверяйте железо.