ну причин работать с матрёшкой очень много, поддерживает почти все распрастранённые аудио и видеокодеки и субтитры в любых сочетаниях, отсутсвие рассинхронизации, низкий overhead, поддержка видео с переменной частотой смены кадров, несколько видеопотоков, легкая резка, склейка, задание трекам языка и названия, главы...
а в будущем будут и экранные меню как на DVD.
отличный, удобный и безглючный софт как для создания так и для просмотра.
а также есть очень полезные функции: можно мнгновенно изменить соотношение сторон и теперь информация об AR берется только из контейнера, еще одна великолепная фишка это связь между файлами, допустим вы сжали фильм на 2CD, если смотреть фильм с CD то ничего особенного вы незаметите, а если оба файла составляющие фильм лежат в одной папке то фильм в любом плеере будет воспроизводиться как одно целое (при просмотре вы никаким образом несможете распознать состоит фильм из одного файла или из нескольких), вложения тоже полезная вещь, ну и ещё мелочи есть приятные.
официальный сайт
http://www.matroska.org/ частично на русском (1 мая проекту 2 года исполнится, должны написать отчет что было сделано за год и планы на будущее

)