[bgg0408]

Allex
проверить режим работы винта... См. в менеджере у-в в свойствах иде канала. Должно быть написано в комбобоксе "UDMA if available" и UDMA Mode в строке с режимом винта...
шлейф какой? 80 или 40 жил?
дефрагментация давно делалась? При активной работе, со временем скорость файловой системы довольно сильно уменьшается...
а ФС - НТФС? Тогда еще и неплохо оставить процентов 10-20 на разделе свободными. У НТФС есть неприятная особенность тормозить при маленьком размере свободного места на диске...