лично я сейчас пользуюсь несколькими программами.
1.
WinTools.Net.Pro (как тут уже отметили) -
http://wintools.net/
2.
TuneUp Utillities 2004 -
http://www.tune-up.com/
и та и другая - "солянки" из серии много_в_одном в отличии например от RegCleaner-а (который имеет ряд узких функций)
+ на проверку взял
Registry Help -
http://www.foryoursoft.com/reghelp.htm (узкопрофильная чистка реестра + набор твиков)
ну и разумеется, т.к. это не один совмещенный проект каждая из перечисленных находит кучку "битых" ключей после работы другой
лучшее средство - Regedit или
RegWorks и удаление ненужных веток "вручную"... чем периодически раз в 3 мес. и занимаюсь.
от
System Mechanic отказался, когда в него интегрировали антивирус и раздули проект до ~20 Mb
RegCleaner - закрытый проект перекуплен следующей строкой
jv16 PowerTools и
RegSuprime от
http://www.macecraft.com/ не могу ничего сказать. не пробовал. некоторым - нравится...