Far к сожалению не знаю, но судя по тем возможностям, которые описывал коллега
Iska, он ощутимо лучше чем Total Commander.
В Total Commander нужно запустить поиск через alt+F7, в появившимся диалоге зайти во вкладку "Дополнительно", там установить галку "поиск дубликатов", выставить галочки что именно сравнивать - можно учитывать имя, размер, содержимое, кроме того - учитывать данные плагинов, а плагины обеспечивают доступ к мультимедийным данным - например если совпадает альбом, или исполнитель. Но это если он в принципе заполнен в тегах.
Мои эксперименты по поиску дубликатов среди музыки закончились вполне успешно, но перекодированные клоны он разумеется искать не может.
PS раз уж дело коснулось тегов аудиофайлов, несмотря на отсутствие вопроса упомяну очень полезную программу для автоматического заполнения тегов -
Tagscanner, не лишняя при каталогизации аудиофайлов. Позволяет генерировать теги автоматически исходя из названий папок и файлов.