[DA-Bro]

Но так и не понял логику вопроса. »

Здравствуйте! Вот что нужно:

Папку с шаблонами нужно скопировать в папку с программой.
Если установщик находит программу (если она установлена) в "Program Files (x86)" то копирует файлы туда, а если программа находится в "Program Files" то по этому пути.
Если программа не установлена то по идее нужно чтобы появилось сообщение об этом или просто остался путь по умолчанию.

Тут речь идёт не об установки программы а шаблонов в эту программу. Соответственно и "Program.exe" нет в установщике, не указан.