[DJ Mogarych]

Powershell:

Код:

dir "D:\temp\12345" -Recurse |? {!$_.psiscontainer -and $_.fullname -match "rinex"} |% {
$r = $_.fullname.split('\')[-3]
$txt = (gc $_.FullName) -replace "\d{4}( MARKER (NAME|NUMBER))",($r + '$1')
$txt |Set-Content $_.fullname
}

Особенно не тестировал, проверьте сначала на пробном наборе данных.