[Sham]

Get-Content без -raw отдаёт массив строк, который при коэрсии в строку просто конкатенируется без знаков переноса. Из-за этого у ТС некорректно писался файл с потерей символов переноса строки.

Проблем при интерпретации бинарных данных однобайтовой текстовой кодировкой возникать не должно. Вот при многобайтовых юникодах могут быть некорректные последовательности байтов. Вот такие случаи все протестировать можно, конечно, при большом желании. Глюк может вылезти в любой момент.