[megaloman]

оба уже пустых временных каталога »

ИМХО, слишком много временных каталогов, хватает одного.

Код:

@Echo Off
	Set "BoxIn=Z:\Soft_In"
	Set "Mask=*.txt"

	Set "MyTMP=%BoxIn%\%~nx0.tmp"
	
	2>nul Rd /Q /S "%MyTMP%"
	Md "%MyTMP%"	

	Set /A N=0
	For %%i In ("%BoxIn%\%Mask%") Do (Set /A N+=1 &>nul Call Move "%%i" "%MyTMP%\%%N%%%%~xi")

	>nul Move "%MyTMP%\*.*" "%BoxIn%\"
	Rd /Q /S "%MyTMP%"
Exit /B

Я раньше тоже предполагал такой вариант, решил, что он будкт медленнее, но по времени одно и то же.
Кстати, в vbs пришлось делать именно Move, переименовать файл я не умею.