[Avatar-Lion]

Периодически начинает скрипеть винтом и довольно часто »

Если вас раздражает звук работающего HDD, то замените его на SSD.

обычно после загрузки системы »

После загрузки системы много чего еще может дозапускаться после входа на рабочий стол, особенно в течение первых 5-10 минут.

независимость от активности пользователя (и не прекращение после шевеления мышью) »

Точно не фоновая дефрагментация. Она на клавиатуру \ мышь именно реагирует. Я бы даже сказал, она чрезмерно чувствительная в этом плане, реагируя даже на одиночные действия юзера. Например, сидишь читаешь что-то в браузере, кликнул на следующую страницу - и всё, дефрагментация утихла, хотя никоим образом не мешала.

просмотр логов Process Monitor »

К чему такие сложности? Монитор ресурсов > Диск. И посмотрите кто там и какими файлами шуршит.

именно эти параметры советуют отключать в гугле »

Отключать зачем? Чтобы дольше загружалась ОС и ПО? Тупые советы какие-то...

встроенный дефрагментатор имеет больше полномочий, чем Auslogics Disk Defrag »

Вы не поверите, но кроме встроенного дефрагментатора больше ничего и не требуется, чтобы содержать диск в порядке.

P.S. Гляньте, кстати, здоровье HDD на всякий пожарный.