[DrHitman27]

Нашёл решение проблемы. Сравнение логов Process Monitor с пк, где нет проблемы помогло найти отличия в реестре.

Код:

Windows Registry Editor Version 5.00

[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Policies\System]
"EnableFullTrustStartupTasks"=dword:00000002
"SupportFullTrustStartupTasks"=dword:00000001
"SupportUwpStartupTasks"=dword:00000001

Ещё там есть такое, но и без него работает.

Код:

"EnableUwpStartupTasks"=dword:00000002

Сами настройки автозагрузки программы, записываются в

Код:

Компьютер\HKEY_CURRENT_USER\Software\Classes\Local Settings\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\AppModel\SystemAppData\ *Компания.ИмяПрограммы* \EPMStartupTask
"State"=dword:00000002

одного этого параметра достаточно, если удалить весь раздел с именем программы, то в диспетчере задач автозагрузка исчезает.

Vadikan, достаточно подробностей?