[megaloman]

Код:

@Echo Off
	Call :GTR "Z:\Base\1\*.txt" 6 || Echo 1 Больше
	Call :GTR "Z:\Base\2\*.*" 6 || Echo 2 Больше
	Call :GTR "Z:\Base\3\*.vbs" 2 || Echo 3 Больше
Exit /B

:GTR
	FOR /F "usebackq Skip=%2 delims=" %%f IN (`2^>nul Dir %1 /B /A:-D`) DO Exit /B 1
Exit /B 0

В приложении к Вашему случаю пишИте сами, например:

Код:

@Echo Off
	Call :GTR "Z:\Base\1\*.txt" 6 || (echo net stop sqlserveragent &echo del /S /Q Z:\Base\1\*.txt &echo net start sqlserveragent)
	Call :GTR "Z:\Base\2\*.*" 6 || (echo net stop sqlserveragent &echo del /S /Q Z:\Base\2\*.* &echo net start sqlserveragent)
	Call :GTR "Z:\Base\3\*.*" 5 || echo Call "Z:\tralala\kuku.bat"
Exit /B

:GTR
	FOR /F "usebackq Skip=%2 delims=" %%f IN (`2^>nul Dir %1 /B /A:-D`) DO Exit /B 1
Exit /B 0

Батник поместИте в планировщик и делайте с нужным вам интервалом