[Avatar-Lion]

Я бы на вашем месте именно в отдельный каталог ставил всё. Вроде того, как вы предложили (C:\opt), чтобы точно не было проблем с правами, пробелами и прочей ерундой. Формально ProgramData тоже подходит под ваши нужды, но там много кто хранит свои настройки: система, программы, игры, драйвера... Короче, вы сами же запутаетесь в итоге где ваше, а где не ваше. Шлёпните случайно подкаталог не тот какой-нибудь в этой ProgramData и будете потом с глюками на ровном месте разбираться. Вам оно надо? Реально, организуйте отдельную папку и туда скидывайте всё необходимое ПО.

Насчет бэкапа - это уж сами смотрите. Если настроен бэкап только отдельных каталогов типа C:\Windows, то вашу C:\opt придется добавить в список того, что нужно бэкапить. Если же архивируется весь диск С: целиком, то ничего делать не нужно. UAC вас беспокоить не должен, ибо с точки зрения системы C:\opt является обычной папкой и UAC мешать должен не больше, чем при работе с любой другой директорией. Реестр тут вообще никаким боком. Если ваше ПО вносит в реестр записи о путях установки, то ему без разницы какой путь прописывать - ProgramData или opt.