[YuS_2]

Сколько в интернете прочитал, толком не могу найти информацию как правильно взять определенную информацию и потом ее использовать. »

В cmd не совсем просто разбирать такой текст...
Попробуем с помощью того же powershell
script.ps1

Код:

#requires -v 3.0
$fld = "\\.\FAT12_F\*****"

$tmp = cmd /c """С:\путь_к_ менеджеру_крипто_про\certmgr.exe"" -list -cont ""$fld"""

$str = $tmp|?{$_ -match 'Not valid before|Subject|Issuer'}|convertfrom-string -d ' : '
$issuer = $str[0].p2 -split ','|convertfrom-stringdata
$subject = $str[1].p2 -split ','|convertfrom-stringdata
$date = [datetime]::parse(($str[2].p2 -replace 'UTC','GMT'))
$a = ($subject.cn -replace '"')+$(" {0:dd.MM.yyyy} " -f $date)+($issuer.cn -replace '"')

cmd /c "csptest.exe -keycopy -src ""$fld"" -dest ""\\.\FAT12_G\$a"" -pindest="""""

Проверять мне не на чем, поэтому проверяйте у себя.
Особенно следует обратить внимание на путь к контейнеру и отрабатывание команд содержащих запуск cmd.

\\.\FAT12_П »

- это правильно указано в Вашей строке?