shadowbat,
iconv.exe в качестве альтернативы не смотрели.
Точно её возможности не знаю, но посмотреть можно.
самый простой пример
Код:

iconv -c -f utf-8 -t cp1251 1.txt 1>2.txt
Более сложный через ТЕМП, если проблемы
Код:

iconv -c -f utf-8 -t cp1251 1.txt 1>1.tmp && move 1.tmp 1.txt