[Animal]

Самая общая информация - все, что выполняется в фоновом режиме потенциально может приводить к торможению (антивиручные мониторы, кое что из NU). Очень прилично тормозят jpg-картинки на раб. столе. Рекомендую вообще все картинки с раб. стола убрать.
Посмотреть в реестре можно, что запущено в HLM\Software\Microsoft\Windows\CurentVersion\Run ну и аналогично в HCU\... И в автозагрузке глянуть нужно конечно.
В назначенные задания стоит заглянуть. Если комп входит в домен - поговорить с админом.

Если не мудрить с софтом, W2000Pro на указанной конфигурации работает нормально.