[Mean122]

Замена вентиляторов что нибудь даст? »

Мало вероятно. Вентиляторы обычно или работают или нет.

В чем может быть проблема? »

Управление скоростью вращения должно регулироваться ШИМ контроллером. По сути он подаёт импульсы 12В с определённой периодичностью, чем выше температура тем чаще импульсы и следовательно скорость вращения. Следовательно логично предположить, что проблема либо в линии питания вентиляторов (нет нужных 12В на выходе) либо в ШИМ контроллере.
Для подтверждения теории можно поставить MSI afterburner и попробовать регулировать скорость вращения там. Переключить вращение в ручной режим и дёргать ползунок.