[Iska]

Папку захламляют чем попало. »

Кто захламляет? Как именно захламляет? Какие оргмеры принимаются для противодействия этому?

удаляет все папки вне файлов. »

Это, простите, как? Файл не может являться контейнером.

Работает скрипт (VBS), »

Покажите его код. Опишите условия его применения, ибо одновременная работа двух скриптов одинаковой направленности над одним каталогом может приводить к непредсказуемым последствиям.

и при появлении в ней папки, начинающейся НЕ с цифры, переносить эту папку в D:/MUSOR. Более продвинутая хотелка, если можно. При появлении папки, начинающейся не с пяти цифр, »

Определитесь — то или то нужно. «Продвинутости» во втором случае по сравнению с первым нет ни малейшей.