[Angry Demon]

Dmitriy_25.87, надеюсь, бредовому совету по отключению восстановления системы и прочей ереси не следовали?
Изучите для начала:
12 мифов об оптимизации SSD, которые никогда не умрут
SSD не нуждается ни в какой настройке!
Откатите систему на момент ДО своих пируэтов и клонируйте её на SSD.

Я так понимаю программа не может из винды это сделать, т.к. система работает

Может. Про теневые копии и моментальные снимки системы слыхали?

Windows с нормального дистрибутива или говносборка какая-то?