[Angry Demon]

Как отличать говносборку от нормального дистрибутива?

Например, по наличию активатора или встроенного левого KMS-сервера.

Самое удивительное, на этой же самой системе 100% эта команда выполнялась

Попробуйте откатить систему на момент, когда всё работало.

а сервер перезагружался из-за обновлений... и началась чахорда

Сервер, а особенно DC, всегда берёт браузинг в свои руки.

Может быть есть какой-то отдельный журнал, куда система полное описание, что с ней происходит складывает?

Открою тайну, журнал так и называется "Система".