[El Scorpio]

Вам нужно "откатывать" вообще всё (включая обновление программного обеспечения, системных баз и очистку логов) или просто профиль конкретного пользователя?

Если достаточно "просто профиль", то можно прописать на включение компьютера скрипт из трёх команд
1. rm -r /home/username
2. cp /home/user_backup /home/username
3. chown -r username:username /home/username // изменение владельца профиля (владельцем "эталонного" профиля должен быть другой пользователь во избежание изменений)
4. PROFIT!!!!

--------------------------------------------------------------------
Если же нужно "откатывать" вообще все изменения, то как вариант
Установить систему с вынесением системных разделов в LVM. Оставить в LVM много свободного места.
После настройки системы прописать на включение компьютера скрипт с командами, которые для каждого логического раздела LVM выполнят следующие действия
1. Проверка наличия в группе LVM раздела-"снимка"
2. Если снимок существует, то
2.1. отмонтировать раздел (для / - перемонтировать в режим "только чтение")
2.2. выполнить слияние снимка с разделом (это действие возвращает раздел в исходное состояние)
2.3. примонтировать раздел (для / - перемонтировать в режим "чтение-запись")
3. Создать новый снимок