[Iska]

Вот что это:

set "BuildN=set /p Var=<counter »

такое? Для чего это?

Вы хотите получить нечто наподобие:

Код:

@echo off
setlocal enableextensions enabledelayedexpansion

set sBuildNumberFile=counter.txt
<"%sBuildNumberFile%" set /p iBuildNumber= & set /a iBuildNumber += 1 & >"%sBuildNumberFile%" echo !iBuildNumber!
прога.exe %iBuildNumber% ещё аргументы

endlocal
exit /b 0

?!