[Petya V4sechkin]

Стоит ли его чистить, если выше 28-29 из 32ГБ память не выжирается, если очистить этот кэш, как это скажется на работу процессов, очередь обращения к дискам ?

Ну если Metafile бесконтрольно растёт, можно и сбросить иногда.
Кроме того, по ссылке там подробный гайд по использованию Dynamic Cache Service (DynCache).

дублирование процессов для каждого пользователя - это нормально ?

Да.

P.S. Уточню, что обычно в использовании больших объёмов памяти для кэша нет ничего плохого (в теории это всегда улучшает производительность, хотя на практике бывают и исключения, обусловленные не совсем оптимальными алгоритмами диспетчера памяти).