Vics
Я не считаю целесообразной установку Office на Т-12. Насколько мне известно, она корректно не проходит. Лучше все-таки при первом логоне. Если кто-то успешно установил Офис на Т-12, то сообщите плиз с подробностями.
Теперь по поводу структуры файла RunOnceEx.cmd. Команда на установку Офиса в нем прописана неправильно. Та команда, которая указана на странице Office 2003 предназначена для обычного пакетного файла (start.cmd на странице примеров). Если вы хотите устанавливать Офис из RunOnceEx, то должно это выглядеть примерно так
Код:

REG ADD %KEY%\080 /VE /D "Office 2003" /f
REG ADD %KEY%\080 /V 1 /D "%CDROM%\Software\Office2k3\setuppro.exe /QN TRANSFORMS=my.MST" /f
Обратите внимание, что я использую переменную %CDROM%, также путь к сетапу и имя файла MST отличаются. Идея, думаю, понятна.
Еще у вас Adobe и TotalCommander имеют одинаковые ключи (REG ADD %KEY%\005), и один из них не будет установлен, т.к. ключ в реестре будет перезаписан.
Ну и на всякий случай свой cmdlines.txt приведите.