[Prisoner]

Это не директория (с какой-то вероятностью). В config.pl создавать переменную указывающую на сам файл config.pl? Забавно. Вероятнее всего эта перемеменная должна хранить путь к cgi-скриптамю Тут два пути - создать свою директорию, положить все скрипты туда и вписать путь в переменную или найти обычно лежащий в корне сервера каталог cgi-bin и кинуть все туда, тогда ничего в самом деле менять не надо. Создавать же можно любым нормальным по современным меркам ftp клиентом, например CuteFTP.