[megaloman]

ren "%orgFILE%" "%Rnam%GUImap_%%a"

Как я понимаю, некий файл с именем "%orgFILE%"в цикле переименовывается в "%Rnam%GUI_3_S_%%a" Очевидно, такое переименование возможно 1 раз (я пока не смотрю на остальной синтаксис), так как после первого раза файл уже не называется "%orgFILE%"
Лучше не приводите код, а объясните задачу:
У Вас есть группа файлов. Маску можете указать?
Каждый из этих файлов надо переименовать.
Впереди имени файла и сзади имени файла (перед расширением) что-то надо добавить. Что?

Пишу наугад, так как не очень понимаю постановку задачи

Код:

@Echo Off

Set "BINDIR=Z:\Tra La La"
Set "Mask=ForgeAmidst-*.jar"

Set "Pref=1_"
Set "Suff=-FAXV"

FOR /F "usebackq delims=" %%f IN (`dir /b "%BINDIR%\%Mask%" 2^>nul`) DO Ren "%BINDIR%\%%f" "%Pref%%%~nf%Suff%%%~xf"

В папке %BINDIR% есть файл %%f (например, ForgeAmidst-1.1.1.jar), который переименовываем:
Перед именем добавляем префикс %Pref% (Здесь 1_)
Выделяем из имени файла только имя без расширения %%~nf (например, ForgeAmidst-1.1.1)
После него прибавляем суффикс %Suff% (здесь -FAXV)
После суффикса выделяем из исходного имени файла расширение %%~xf (например, .jar)
Как результат получаем переименованный файл 1_ForgeAmidst-1.1.1-FAXV.jar
Откуда у Вас берётся еще GUImap_ не понимаю.