[composter]

ну можно не списки ,а в переменную записать все названия файлов.
просто первоначальные файлы (они же файлы из 1 списка) во время 1 обработки переименовываются и файлов с таким именем не существует.

порпробовал ваш код

Код:

chcp 1251
set "d1=C:\333\444"
set "d2=C:\333\555"
for /f "delims=" %%a in ('dir/a-d/b "%d1%"') do if not exist "%d2%\%%a" echo copy ^(Копируем недостающие^) "%d1%\%%a" в "%d2%\"
echo Удаляем все совпадающие по имени файлы:
for /f "delims=" %%a in ('dir/a-d/b "%d2%"') do echo del "%d1%\%%a"
pause

вначале в папку 444 переместилл 6 файлов из них 4 в 555, потом наоборот - результат ничего не изменилось после запуска скрипта