[Iska]

marillion13, вероятнее всего, использованная Вами ранее версия Wise Folder Hider Pro была отлична от текущей — 3.41.117, и в ней как-то иначе осуществлялось «скрытие».

Ну, давайте ещё попробуем такое: откройте Far Manager, выведите на левой панели содержимое корневого каталога диска C:, на правой — содержимое корневого каталога диска D:, установите режим отображения Full (Полный) для каждой панели, распахните его окно на весь экран (Alt-F9), затем сделайте скриншот его окна (Alt-PrintScreen) и выложите последний.