[alpap]

Код:

@echo off
set "d_in=papka_in"
set "d_out=papka_out"
for /f "delims=" %%a in ('dir/a-d/b "%d_in%\*.jpg"') do set/a n+=1& set "m=00!n!"& copy "%d_in%\%%~nxa" "%d_out%\!m:~-3!%%~xa"
pause>nul

если именно перемещать copy поменяйте на move

что делать, если файлов окажется более 999? »

это остается под вопросом.