[Iska]

А если я запускаю данную программу не через скрипт а через ассоциированный с данным приложением файл? »

Её и не нужно было запускать «через скрипт». Не знаю, откуда Вы это взяли.

Например,при запуске .mp3 запускался бы Windows Media Player + другая программа. »

Что будет запускаться (или не запускаться) для обработки определённого документа — указано в реестре.

P.S. Если Вас устроит вариант, предложенный коллегой Nordek, то сим и ограничимся.