Мне все вышеперечисленные манипуляции не помогли, Но я в другой ветке нашёл СВОЁ решение.
http://forum.oszone.net/thread-233211.html
Этот REG файлик всё-таки решил проблему отсутсвия ассоциации для *.CMD файлов.
Windows Registry Editor Version 5.00
[HKEY_CLASSES_ROOT\.bat]
@="batfile"
[HKEY_CLASSES_ROOT\.cmd]
@="cmdfile"
[-HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\FileExts\.bat]
[-HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\FileExts\.cmd]