[dislike]

Цель - повысить отказоустойчивость системы »

Извините, но вы выбрали бредовый метод повышения отказоустойчивости. Вот вы работаете в своей системе, всю её настроили, установили нужные программы, настроили, обновили, пятое, десятое, сломали (хотя сломать современную систему до полной незагружаемости - надо талант иметь), подключаете вторую запасную и что? Всё заново ставить-обновлять-настраивать? Это же чушь, так никто не делает.
Хотите отказоустойчивость - оставьте один HDD с одной рабочей настроенной сиситемой, установите какой-нибудь Акронис, который будет вам штамповать по расписанию полные образы вашей системы со всеми её разделами на второй диск. И то лучше будет. Хотя и то и то по сути бесполезная трата ресурсов потому что

сломать современную систему до полной незагружаемости - надо талант иметь