[Charg]

В планировщике на ночь что-нибудь запланировано?
Может какое-то по или настройки пытаются принудительно отправить сервак в сон\гибернацию?
Каким вообще образом определяется что сервер завис?
Что служит сервером, обычный комп или виртуалка или еще что?
Нужно больше подробностей.

Попробуй банально написать батник который раз в минуту к примеру будет в текстовый файл писать текущее время и оставить на ночь, потом придешь на работу на следующий день и посмотришь в какое время собственно всё зависает.