[Creat0R]

в вашем варианте рекурсия происходит в каждой из групп, а нужно чтобы рекурсивно происходило в обеих группах. »

Не совсем понял, что значит в обеих?
1 привязан к 1.1, а 2 к 2.2.

Может так:

Код:

#cs ----------------------------------------------------------------------------
 AutoIt Version: 3.3.14.2
#ce ----------------------------------------------------------------------------

#include <GUIConstantsEx.au3>

Opt("TrayIconDebug", 1)
Opt("TrayIconHide", 0)
Opt("GUICloseOnESC", 1)
;^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
Beep(1000, 150)
GUICreate("TEST", 440, 440)
$nInst = GUICtrlCreateButton ("Run",  7, 410, 80, 22)
$Close = GUICtrlCreateButton ("Exit",  350, 410, 80, 22)
$icon = GUICtrlCreateIcon ("@ScriptDir & '\name.exe",0, 29,375,32,32)
;^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
GUICtrlCreateGroup("Disable", 7, 15, 426, 170)
GUICtrlSetFont(-1, -1, 700)
DllCall('UxTheme.dll', 'int', 'SetWindowTheme', 'hwnd', GUICtrlGetHandle(-1), 'wstr', 0, 'wstr', 0)
GUICtrlSetColor(-1, 0x0000FF)
$id1 = GUICtrlCreateCheckbox ("CHECKBOX 1", 12, 40, -1, -1)
$id11 = GUICtrlCreateCheckbox ("CHECKBOX 1.1", 12, 230, -1, -1)
$id2 = GUICtrlCreateCheckbox ("CHECKBOX 2", 12, 60, -1, -1)
$id12 = GUICtrlCreateCheckbox ("CHECKBOX 2.2", 12, 250, -1, -1)
;^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
GUICtrlCreateGroup("Restore", 7, 200, 426, 170)
GUICtrlSetFont(-1, -1, 700)
DllCall('UxTheme.dll', 'int', 'SetWindowTheme', 'hwnd', GUICtrlGetHandle(-1), 'wstr', 0, 'wstr', 0)
GUICtrlSetColor(-1, 0x0000FF)
;^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
GUISetState()

While 1
    $iMsg = GUIGetMsg()

    Switch $iMsg
        Case $Close, $GUI_EVENT_CLOSE
            Exit
        Case $nInst
            GUISetState(@SW_MINIMIZE);@SW_MINIMIZE
;^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^Отключить и остановить^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
            If _Checked($id1) Then
                MsgBox(4096+48, '', 'CHECKBOX 1', 1)
            Endif
            If _Checked($id2) Then
                MsgBox(4096+48, '', 'CHECKBOX 2', 1)
            Endif
;^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^По умолчанию^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
            If _Checked($id11) Then
                MsgBox(4096+48, '', 'CHECKBOX 1.1', 1)
            Endif
            If _Checked($id12) Then
                MsgBox(4096+48, '', 'CHECKBOX 2.2', 1)
            Endif
            GUISetState(@SW_RESTORE)
        Case $id1, $id11, $id2, $id12
            $iNext = $iMsg + 1

            If $iMsg = $id11 Or $iMsg = $id12 Then
                $iNext = $iMsg - 1
            EndIf

            GUICtrlSetState($iNext, $GUI_UNCHECKED)
            If Not _Checked($iMsg) Then GUICtrlSetState($iMsg, $GUI_CHECKED)
    EndSwitch
WEnd
;^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
Func _Checked($idControlID)
    Return BitAND(GUICtrlRead($idControlID), $GUI_CHECKED) = $GUI_CHECKED
EndFunc   ;==>_Checked

А вообще это делается не с CheckBox, а с Radio.

Код:

#cs ----------------------------------------------------------------------------
 AutoIt Version: 3.3.14.2
#ce ----------------------------------------------------------------------------

#include <GUIConstantsEx.au3>

Opt("TrayIconDebug", 1)
Opt("TrayIconHide", 0)
Opt("GUICloseOnESC", 1)
;^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
Beep(1000, 150)
GUICreate("TEST", 440, 440)
$nInst = GUICtrlCreateButton ("Run",  7, 410, 80, 22)
$Close = GUICtrlCreateButton ("Exit",  350, 410, 80, 22)
$icon = GUICtrlCreateIcon ("@ScriptDir & '\name.exe",0, 29,375,32,32)
;^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
GUICtrlCreateGroup("Disable", 7, 15, 426, 170)
GUICtrlSetFont(-1, -1, 700)
DllCall('UxTheme.dll', 'int', 'SetWindowTheme', 'hwnd', GUICtrlGetHandle(-1), 'wstr', 0, 'wstr', 0)
GUICtrlSetColor(-1, 0x0000FF)
$id1 = GUICtrlCreateRadio ("CHECKBOX 1", 12, 40, -1, -1)
$id11 = GUICtrlCreateRadio ("CHECKBOX 1.1", 12, 230, -1, -1)
;^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
GUICtrlCreateGroup("Restore", 7, 200, 426, 170)
GUICtrlSetFont(-1, -1, 700)
DllCall('UxTheme.dll', 'int', 'SetWindowTheme', 'hwnd', GUICtrlGetHandle(-1), 'wstr', 0, 'wstr', 0)
GUICtrlSetColor(-1, 0x0000FF)
$id2 = GUICtrlCreateRadio ("CHECKBOX 2", 12, 60, -1, -1)
$id12 = GUICtrlCreateRadio ("CHECKBOX 2.2", 12, 250, -1, -1)
;^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
GUISetState()

While 1
    $iMsg = GUIGetMsg()

    Switch $iMsg
        Case $Close, $GUI_EVENT_CLOSE
            Exit
        Case $nInst
            GUISetState(@SW_MINIMIZE);@SW_MINIMIZE
;^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^Отключить и остановить^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
            If _Checked($id1) Then
                MsgBox(4096+48, '', 'CHECKBOX 1', 1)
            Endif
            If _Checked($id2) Then
                MsgBox(4096+48, '', 'CHECKBOX 2', 1)
            Endif
;^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^По умолчанию^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
            If _Checked($id11) Then
                MsgBox(4096+48, '', 'CHECKBOX 1.1', 1)
            Endif
            If _Checked($id12) Then
                MsgBox(4096+48, '', 'CHECKBOX 2.2', 1)
            Endif
            GUISetState(@SW_RESTORE)
    EndSwitch
WEnd
;^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
Func _Checked($idControlID)
    Return BitAND(GUICtrlRead($idControlID), $GUI_CHECKED) = $GUI_CHECKED
EndFunc   ;==>_Checked