[User001]

DNS-серверы. . . . . . . . . . . : 109.125.131.1 109.125.141.1 »

Убираем в сервера пересылки. В серверах ДНС в настройках сетевых интерфейсов должны быть только контроллеры домена.

с второго контроллера, он же прокси »

Так в принципе не надо делать.

на основном с временем беда, нет вообще службы времени в службах-из-за этого везде сообщение что время и дата не совпадает? »

Скриншоты, журнал ошибок?

а на втором не видит днс основного -из-за этого нет синхронизации со вторым доменом? »

странно, что могло повлиять? как исправить? »

Да, настройки неверные.