[SuBZeRrro]

Для примера http://forum.oszone.net/post-2524101-6.html »

Уже предлагали этот вариант несколько сообщений выше, так не скрываются в трей консольные приложения.
Да и вряд ли есть способ сделать это при помощи ресурсов системы.
Тут скорее вопрос можно ли написать команду чтобы .bat файл кликнул правой кнопкой мыши по кнопке "свернуть".