[Iska]

проверил их по md5, они разные, что ей не нравится? »

Ваш перевод не нравится. Буквально — это не ошибки, а предупреждения:

Код: WARNING: These two files are identical for the first 65536 bytes, but differ at some point beyond that. This could be intentional, but it might indicate that one of these two source files is corrupt: \\?\E:\REPACK\Uttended\$OEM$\$$\Resources\Themes\Shell\Blue\shellstyle.dll \\?\E:\REPACK\Uttended\$OEM$\$$\Resources\Themes\Shell\Brown\shellstyle.dll

В вольном переводе:

Предупреждение: эти два файла идентичны как минимум в первых 65536 байтах, но отчасти различаются последующим содержимым. Это может быть сделано сознательно, но также может сигнализировать, что один из этих исходных файлов повреждён.

То есть, Вы должны проверить не то, что они не совпадают по контрольной сумме MD5 (утилита как раз и говорит Вам о том, что они различны), а тот факт, что они действительно должны быть различны.

Меня лично несколько настораживает именно очень круглое число «65536», хотя, с другой стороны, это может быть и банально размер буфера сравнения утилиты (навряд ли она занимается побайтовым сравнением одноимённых файлов).