[El Scorpio]

Имелось ввиду установить систему на диск не находящийся в массиве, затем клонировать его на raid1 массив »

"Клонировать" или скопировать/перенести?
В любом случае - что будет со старой системой, которая сейчас работает на массиве RAID?
При "клонировании" (чтобы вы здесь не подразумевали) старая система и вся информация дискового устройства будет затёрта новыми данными.

Может тогда лучше сделать архивную копию установленной системы (образ диска всего массива RAID) на внешний или иной жёсткий диск, а потом выполнить переустановку системы сразу в RAID-массив?
Если что-то пойдёт не так - вы восстановите старую систему из архивной копии.



Что касается самого первого требования

Нужно поменять систему, но без отрыва от работы бухгалтерии. »

Установка системы на другой диск однозначно потребует прекращения работы компьютера. Невозможно "установить вторую систему в фоновом режиме".
Или вы хотите запустить установку новой операционной системы в отдельной виртуальной машине, а потом сделать её "развиртуализацию" - перенести на физическое оборудование?