[Iska]

1. Необходимо, чтобы файлы формата *.exe скачивались в единую директорию независимо от того, какое ПО их скачивает - браузеры/менеджеры скачивания и т.п. »

Реализация хотелки невозможна по определению.

2. Необходимо, чтобы любое ПО, запускаемое в системе, при попытке скачать exe файл с заранее известного домена брала этот файл не из сети, а с указанной папки локалхоста. »

Аналогично.

Второй пункт легко решается настройкой веб-сервера и добавлением строк в hosts (известный домен = алиас, где алиас = папка C:\files) »

Причём тут веб-сервер? Какие домены, какие «псевдонимы = папка»?!