[Dzirt2005]

так почему она такая становится »

Потому что туда добавляются новые файлы при обновлениях, при установке новых версий, при установке новых программ/библиотек и т.д.

... ведь система обновляет файлы старые новыми (заменяя их) »

Это вы только что придумали или вам подсказал кто? Ну так неправильно это. В этом каталоге складируются все версии файлов, как раз на тот случай если программе А нужно ms.dll (условно) версии 1.0, а программе B нужна ms.dll (имя не случайно то же самое) версии 2.0. Причем версия 2.0 напрямую не совместима с версией 1.0. Собственно именно это (работа с разными версиями библиотек) и была основная цель создания каталога WinSxS и его содержимого.