[__sa__nya]

Petya V4sechkin, сравню отпишу, а пока, что проверил еще:
1. На виртуальной машине, проблемы с 1С под всеми пользователями, включая администратора, у которого проблем с 1С на боевой машине нет (может просто так попадало что когда проверял не было).
2. Создал пользователя с профилем в стандартном расположении - c:\users\%username% - у такого пользователя проблема при закрытии 1С так же наблюдается, т.е. проблема не в том, что профили пользователей перенесены.