[shao]

Вы озвучиваете задачу и ставите условия, но отсекаете все возможные варианты выполнения...
То нельзя, сё нельзя... А вы то хоть пробовали сделать всё то на что табу наложили ?

Андроид 4.1.2 перестал видеть встроенную память и сд карту,причем! »

А после чего это случилось. Может чего установили ?

И почему вы собираетесь прошивать с карты, а не через ПК ?
Если к ПК подключаете и он видит ваш телефон как , скажем, USB ComPort - это уже хорошо...
А в рекавери то , хоть можно зайти ?
Может у вас эти памяти все размонтированы ?
И какая модель ?