[olen6]

Ариша, разбейте флешку удобным для вас способом на два раздела: первый FAT32 на 300Мб или больше (т.к. образ WinPE от AOMEI занимает примерно 232Мб), а второй раздел NTFS на всё оставшееся место флешки. Первому разделу присвойте букву и сделайте его активным, скопируйте в проводнике все файлы из смонтированного образа AOMEI на этот FAT32 раздел, удалите букву у FAT32 раздела и присвойте букву NTFS разделу. Таким образом, первый раздел FAT32 будет у вас загрузочным и невидимым в Windows, а второй (NTFS) раздел будет видимым и на него будете размещать ваши архивы.
P.S. Всё это проделал только что самолично, разбивал флешку и менял буквы прямо из Windows с помощью бесплатной BootIce. Такая флешка грузится на UEFI и nonUEFI системах. Если флешка будет готовиться не из Windows Vista, 7, 8, а из Windows XP или WinPE на его основе, то, возможно, придётся подправить на ней MBR и PBR на код Windows NT 6.x.