[User001]

У каждого пользователя, на разных машинах имеются свои данные. Будет ли уместным реализовать доступ между машинами через сервер? Имею ввиду, не открывать шары обычным способом, а как-то иначе, чтоб пользоваться ими могли лишь пользователи домена, в целях безопасности. »

ПК в домене -> можете права для пользователей домена и расставлять.
А на тему у каждого пользователя свои данные:
- пользовательский ПК выключен - нет доступа к данным;
- пользовательский ПК сломался, а пользователь только-только сохранил что-то важное - потерялось.
И так далее. Зависит от того, что за данные, какой объем.