[mwz]

то ли просто из-за нехватки питания хард в коробочке отваливается, и при повторной инициализации контроллера теперь отдаются секторы уже не 4 KiB Native…??? »

Как выяснилось на упомянутом ресурсе, существуют "интеллектуальные" коробочки (точнее, контроллеры в них), которые отдают наружу эмулированные сектора 4K только по необходимости (например, при подключении с неразбитым винчестером >2GiB к WinXP будет дана возможность эмулировать MBR-диск с 4K Native (и далее он и будет оставаться таким пока его не вытащишь из коробочки), а при таком же подключении к Vista и новее отдать его как обычный диск и дать возможность создать GPT-диск с секторами 512 байт (и далее он и будет оставаться таким)). Так что возможно ваше предположение недалеко от истины: из-за багов в микропрограмме или по ещё каким причинам.