[El Scorpio]

Возможно ли сразу указать логины в 2 языках и пользоваться двумя или 1 по выбору ? »

нет

Высокая интеграция с тем же почтовым клиентом и другими ПО »

А вы используете свой почтовый сервер?
Что касается программ, использующих базу домена (MS SQL и т.д.), то здесь разницы не будет.

Один из минусов киррилических символов в учетных данных - не все ПО корректно работает. »

Если только будет сохранять информацию в одной кодировке, а загружать - в другой. Например кодировки 866 для DOS и 1251 для Windows.
Также могут быть проблемы при чтении логов программ.

Обязательно будут проблемы с ПО для Linux.
Вряд-ли получится настроить прокси-сервер SQUID на автоматическую авторизацию пользователей средствами Kerberos (по учётной записи домена).
А если и получится, то не получится собирать статистику через SARG, потому что в логи будут писаться крякозяблы.
Впрочем, опять же можно будет пропускать access.log через конвертер кодировки...