[zai]

и пароли выхода в сеть »

это не сохранится, т.е. настройки находятся в папке /etc/network (NetworkManager или т.п.), поэтому придется подключаться к интернету заново, т.е. позвонить (или посмотреть на сайте) провайдеру или посмотреть настройки в договоре.

И тема, и значки »

Если тема и значки находится в папке /home, то да.

параметры программ, и установки браузеров, и настройки эмулятора Wine, и т.п. и т.д.? »

Да

А то как-то страшновато все запороть »

Сделай образ дика, если что вернешь все обратно как было.