[El Scorpio]

понять, зачем хранить все письма на компьютере сложно »

Совсем не сложно.
Если у вас интернет работает медленно, то данная возможность существенно ускоряет повторное чтение писем, особенно содержащих большие вложенные файлы.
Опять же, ГромоПтиц может помещать отправленные письма в локальную базу, а не в папку "Отправленные" почтового сервера
И да, если вы работаете с почтой по протоколу POP3, то локальная база - единственно возможный способ хранения почты.

Правильно ли работает Thunderbird, съедая столько места? »

Если вы считаете это излишним, то в параметрах учётной записи почтового ящика на странице "синхронизация" снимите галочку "Хранить сообщения для этой учётной записи на этом компьютере"
Однако при медленном интернете вам будет сложно искать нужные письма. Также по закону подлости именно в тот момент, когда вам нужно будет достать с почты старое письмо, интернет отключится.