[mwz]

Корзину в папке $RECYCLE.BIN очистил, кликнув ПКМ - выбрав "Очистить корзину" »

Это вы очистили Корзину только того пользователя, под которым в этот момент сидели. Мне иногда после подключения диска к разным компьютерам приходится через Total Commander удалять по пять-десять корзин тех пользователей, под которыми работал на тех компьютерах.

Возможно проблема была из-за портативного софта? »

Или из-за того, что NOD32 его держал. Но это лишь как предположение.

ILYa, кстати... При удалении PortableApps файлик Autorun.inf тоже удалили?
(у меня этот комплект, если имеется в виду с этого сайта, лежит не в корне диска, а чуть глубже, и в корне этого файла нету – а внутри вложенных папок он бесполезен)