[lxa85]

Alex Newman, просто попробуйте предложенное решение. Это правда быстрее, и то, что вы просили.
Синхронизация идет по последнему изменению.
Т.е. на облаке все время будет актуальная версия. Просто копируйте ее с пониманием.
Если хочется более гибкого управления -- попробуйте системы управления версиями. SVN, Git, Hg, etc.
В принципе с той же "подложкой" в виде дропбокса или иных платформ.

Рабочая директория 1 | Директория синхронизации 1| Облако | Директория синхронизации 1 | Рабочая директория 2
О копирование различных файлов "руками" подскажет операционная система.